se le gm del 90 e 99 non sono presenti

nelle province in cui le gm del 90 e 99 non ci sono più, si comincerà direttamente dalle assunzioni su tutti i posti in od suddivisi tra gm 2012 e gae?

Se c'è la GM 2012, le GM 90 e 99 sono già decadute.

Si, la fase ordinaria prevede di utilizzare TUTTE le GM ancora valide, comprese quelle '90 e '99 dove possibile, ma non esclude quelle 2012, anzi.
Per cui nella gran parte dei casi si comincerà dalle GM 2012.

La differenza in fase a, straordinaria, è che dove si stavano usando le vecchie GM in fase ordinaria, senza sicuramente giungere ad esaurirle e non essendoci ovviamente le GM 2012, si procederà poi solo da GaE (commettendo un errore madornale che trascinerà la questione per anni nei tribunali).